秦良玉不仅擅长带兵打仗，而且十分注重军需的生产。如今北京四川营胡同附近，还有十几条“棉花胡同”，分头条、上二条、下二条等名称。这也与秦良玉有关。
她在北京驻扎期间，曾令部下与女眷纺棉织布，故而附近的一些胡同就被后人呼之为“棉花胡同”。
清代曾有人写《四川营吊秦良玉驻兵遗址》一诗咏道:“金印夙传三世将，绣旗争认四川营。至今秋雨秋风夜，隐约钲声杂纺声。”
秦良玉不仅擅长带兵打仗，而且十分注重军需的生产
又过了十来年，起义军张献忠进入四川一带，年过花甲的秦良玉再次披挂上阵，风采不减当年。她率领白杆兵，连战连捷，解除太平之围，扼反将罗汝才于巫山，斩叛帅东山虎于谭家坪，使张献忠的军队在川地吃尽了苦头。
然而，由于川地屡经兵灾，府库空乏，损耗的兵力和粮饷无法补充;而起义军部队势力强大，潮水般涌进川蜀，在整个战局上，官兵是无法取胜的。秦玉良万般无奈，只有退保石柱一地。
英勇善战的秦玉良
面对着潮水般的义军，英勇善战的秦玉良也只能哀叹“大厦将倾，一木难支”。这时京城已被李自成所率领的义军攻破，明思宗自缢于煤山，大明皇朝在风雨飘摇中终于彻底倒塌，李自成入主京城，张献忠则想牢牢控制住川蜀，以作为自己的据点。
刘继兴考证，张献忠东征西战，几乎囊括了全蜀，却唯对石柱弹丸之地无可奈何。已68岁高龄的秦良玉，带着她手下历经百战的白杆兵，不畏强暴，誓死抗拒。
这时的石柱孤立无援，如同汪洋大海中的小舟，随时有被吞没的危险。秦良玉对自己的部众说道：“吾兄弟二人皆死王事，吾以一孱妇蒙国恩二十年，今不幸至此，其敢以余年事逆贼哉!”
并下令：“有从贼者，族无赦!”分兵镇守四境。张献忠对四川各地土司都成功招降，却“独无敢至石柱者”。一直到张献忠败亡，他的起义军终没能踏入石柱半步。
